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Snake demande à Big Boss si lui aussi va retourner à zéro. Son père lui répond qu'il l'a déjà effacé deux fois, et aujourd'hui sera la troisième. Snake ne comprend pas, et Big Boss continue son discours. FOXDIE que Zero a injecté en Snake a probablement déjà commencé à ronger le corps de Big Boss. Ce FOXDIE a aussi tué Eva et Ocelot. «C'est Naomi qui m'a tout dit» précise Big Boss avant de s'effondrer sur le sol. Big Boss explique à Snake que les Patriotes ont recommencé. Ils ont utilisé Snake pour tuer Big Boss. Après tout, les Patriotes ne sont rien de plus qu'un programme. Ils ne savent que répéter continuellement la même chose. Big Boss demande à Snake de l'aider à se relever et de l'emmener à la tombe de The Boss où il avait déjà posé des fleurs. Snake s'exécute et Big Boss lui dit qu'il y a une autre chose que Naomi voulait qui lui dise. C'est à propos du vieux FOXDIE dans le corps de Snake, celui qui a muté. Le nouveau FOXDIE que les Patriotes ont implanté continue à se multiplier. En même temps, il empêche le vieux FOXDIE muté de se reproduire. Le nouveau FOXDIE est en train de supplanter l'ancien. Naomi l'a confirmé dans son dossier de suivi. Les mutants disparaissent. Bientôt, ils auront tous disparu. Snake est soulagé. La souche mutante ne va pas provoquer une épidémie. Mais un jour, le nouveau FOXDIE commencera lui aussi à muter et à représenter une nouvelle menace. Enfin, si Snake arrive à rester en vie aussi longtemps. Le vieillissement affecte tout le monde. Impossible de le stopper ou de lui échapper. Big Boss conseille à Snake de ne pas gâcher la vie qu'il lui reste en se battant. Big Boss n'a jamais considéré Snake comme un fils. Mais il le respecte en tant que soldat et en tant qu'homme. Si Snake avait été à la place de Big Boss, il n'aurait peut-être pas fait les mêmes erreurs que lui.